在曹操的控制下，刘协虽然名义上仍然是皇帝，但实际上已经成为了曹操的傀儡。曹操利用汉献帝的名义，发布诏令，号令各地诸侯，从而扩大了自己的影响力。同时，曹操也通过一系列的政治手段，削弱了其他诸侯的势力，使得自己的地位越来越稳固。

在曹操的治理下，中原地区得到了一定程度的稳定和发展。然而，汉献帝刘协的处境却越来越艰难。他虽然贵为皇帝，但却没有任何实权，只能任人摆布。此外，曹操还不断加强对刘协的监控和控制，使得刘协的行动受到了极大的限制。

在这种情况下，汉献帝刘协开始寻求反抗曹操的机会。他暗中联络一些忠于汉室的大臣，企图推翻曹操的统治。然而，这些努力都没有取得实质性的成果，反而引起了曹操的警觉。

在一次密谋中，汉献帝刘协和一些大臣计划在宫中宴请曹操，趁机刺杀他。然而，这个计划被曹操识破，他提前做好了准备，不仅没有被刺杀，反而借机清除了一批反对他的大臣。这次事件使得汉献帝刘协彻底失去了反抗曹操的机会，他只能继续忍受曹操的控制。

建安五年（200年），董承等人谋诛曹操事泄，刘备投靠袁绍，董承被杀。建安十二年（207年），曹操基本统一北方后，率军南下，准备一举消灭孙权和刘备。赤壁之战爆发，孙刘联军大败曹军，奠定了三国鼎立的雏型。建安十三年（208年），曹操任丞相。建安十八年（213年），曹操获封魏公，建立魏公国，定都邺城，而后进爵魏王。

刘协在位期间，历经多次政变和战乱，始终未能掌握实权，只能被动地接受各种政治力量的摆布。他的一生充满了无奈和辛酸，虽然他曾试图反抗，但最终都以失败告终。尽管如此，刘协仍然保持着一定的气节和尊严，没有完全沦为傀儡。

公元 214 年，伏皇后写信给自己的父亲伏完，信中的内容是希望伏完能想办法除掉曹操，但不幸的是这封信被曹操截获了。曹操以此为由逼迫汉献帝刘协废黜伏皇后，并将伏氏一族满门抄斩，就连伏皇后与刘协所生的两个皇子也未能幸免。伏皇后最后被幽禁至死，而刘协则被迫继续当他的傀儡皇帝。

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曹操去世后，曹丕继承了魏王的爵位。此时，中原地区已经实现了和平，天下各方势力纷纷建立新的王朝。于是，有人劝说刘协效仿唐虞旧事，将皇位禅让给曹丕。

不久之后，刘协正式将皇位禅让给曹丕，并亲自到祖庙祭祀禀告。曹丕则允许刘协在自己的封地里，继续使用汉朝的历法和服饰，建立汉宗庙来供奉汉室祖先。然而，当时社会上流传着刘协已被曹丕杀害的谣言，刘备听闻后，以汉室宗亲的身份称帝，建立蜀汉政权。在刘协人生的最后阶段，他终于摆脱了傀儡的身份，回归自我。在封地里，他广施仁政，深入研究自己钟爱的医术，走访贫困百姓，帮助他们解决困难。此时的刘协，已经远离了政治的纷扰，过上了自由自在的生活。

公元234年，汉献帝刘协走完了他的一生，享年54岁。在他去世后，魏明帝曹叡以天子的规格和礼仪将其安葬，并赐谥号“孝献皇帝”。

刘协的葬礼庄重肃穆，彰显了他作为汉室末代皇帝的尊贵地位。在葬礼仪式上，人们身着丧服，面容悲痛，纷纷向这位曾经的天子表示最后的敬意。

尽管汉朝已经灭亡，但刘协仍然被视为汉室的象征，他的死也引起了社会各界的广泛关注和哀悼。许多人对他的遭遇感到同情，认为他是一个不幸的皇帝，生逢乱世，无法挽救汉室的衰落。

在历史的长河中，刘协的一生充满了坎坷和波折。他曾多次被迫迁都，遭受权臣的控制和压迫。然而，他始终保持着对汉室的忠诚和尊严，尽力维护着自己的皇位和国家的利益。