乾清宫稍稍安静，孙承宗声若洪钟进言：“陛下，杨都督言之有理，五军都督府要废，都指挥使司要废，臣认为总兵为常设官，提督亦为常设官。

鉴于以前各镇军事主官为总兵，各协军事主官为副总兵，而参将、游击、守备又是来自卫所官吏，不光编制混乱，参将、游击、守备因其特殊性，逢战兵勇留一半，臣建议把提督，总兵，副总兵提拔为高级将领，参将，游击代替以前总兵，副总兵位置，因各地战况不同，总兵统领三到五个卫所，独立领禀数量至少达到万人。

提督以下将领只有统兵权，而无调兵权，构成镇辖协，协辖营，形成隶属，若朝廷担心总兵权柄过大，形成地方割据，不妨让巡抚，布政使牵制提督。”

然而，不等朱由校表态，王家桢望向杨肇基，孙承宗询问：“杨都督，孙阁老，提督总领各省军务，然卫所寓兵于农，难道要另设机构管理军户？”

顷刻，乾清宫内，文臣武将又掀起争论。

朱由校熟视无睹，任由百官争吵。

昔年，太祖唯恐军事权力过分集中，导致自己大权旁落，施行复杂的兵制。随着时代变化，历任皇帝缝缝补补，导致军制越发混乱。

杨肇基有句话说的没错，总兵至始至终都是差遣官，卫所制荒废后，募兵兴起，却是卫所制和营兵制并行，军队没有明晰的垂直体系。

大明营兵制始终处在不成熟状态，尽管不断发展，不断调整，可惜始终未能成功。

还是松锦之战，曹变蛟为东协总兵，东协负责山海、石门、燕河、建昌四路，马科为山海关总兵，彼此军队却互不统属。

清朝，绿营兵制则是对明代营兵制的直接继承，彻底摆脱卫所的掣肘。

思索良久，朱由校本欲效仿绿营制施行养兵制，奈何朝廷没有改变存留起运银分配模式，即使户部，内帑现银不少，但招架不住百万大军，动辄数千万的军饷。

所以，他打消这个念头。

朱由校揉了揉鬓角，抬头挺胸端坐，轻咳两声停止百官讨论，掷地有声说：“朕计划废都指挥使，改为提督，将总兵和都指挥使互不隶属，改为总兵隶属提督。提督，总兵，皆为常设官。

因总兵所辖的君镇大小，重要程度各不相同，故而兵力不做平均分配。